建文元年（公元1399年），朱棣在北平起兵，打着清君侧，靖国难的旗号，说齐泰、黄子澄是奸臣，要进京侄子清理门户。这就是历史上的靖难之役。

朱允炆听说叔叔反了，刚开始还挺淡定，觉得自己是正统，派个几十万大军过去，分分钟就能把朱棣摁死。他任命老将耿炳文为帅，率军北伐。可没想到，耿炳文擅长防守，不擅长进攻，刚打了个小败仗就缩在城里不出来了。

这时候，黄子澄又出了个馊主意：陛下，耿炳文不行，换李景隆吧！这小子是名将李文忠的儿子，肯定厉害。朱允炆信了，让李景隆带着五十万大军去北平。

要说这李景隆，真是个。他率军包围北平，眼看就要攻破城门，却因为指挥失误，被朱棣的儿子朱高炽（后来的明仁宗）带人打退。等到朱棣回师救援，李景隆竟然吓得连夜跑路，五十万大军丢盔弃甲，粮草辎重全成了朱棣的战利品。朱允炆气得发抖，却没杀他，还让他接着带兵——不得不说，这心也太宽了。

接下来的三年，靖难之役成了一场魔幻剧。朱棣虽然兵力少，但他身经百战，手下全是精锐；朱允炆这边兵多将广，却总因为战术指挥失误，一错再错。更要命的是，朱允炆还有个命令：别伤着我叔叔，我不想背负杀叔的名声。这道命令，简直是给朱棣发了免死金牌，好几次朱棣身陷重围，都因为明军不敢下死手而逃出生天。

有一次，朱棣在战场上被打得大败，身边只剩下十几个人，眼看就要被活捉，明军却因为朱允炆的命令不敢射箭，眼睁睁看着他跑了。朱棣回去后，摸着脖子笑：我这侄子，真是太贴心了。

建文四年（公元1402年），朱棣看透了朱允炆的底牌，决定玩吧大的——绕过山东，直扑南京。这招risky得很，但效果出奇的好。朱棣的军队一路势如破竹，很快就打到了南京城下。

朱允炆慌了，派李景隆去和朱棣谈判，说愿意割地求和。朱棣笑了：我是来清君侧的，不是来抢地的。李景隆这人，不光会打败仗，还会卖主求荣。他见朱棣势大，竟然偷偷打开了金川门，放燕军进城。

南京城破的那天，皇宫里起了一场大火。等火被扑灭后，人们在废墟里找到了几具烧焦的尸体，太监说那是朱允炆、马皇后和太子朱文奎。朱棣抱着哭了一场：侄儿啊，你咋就这么想不开呢！然后，他以天子礼把这几具尸体埋了——至于埋的是谁，只有天知道。

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